当看到这个问题时，我也很疑惑，药师经和药师咒到底有什么区别，因为我自己对这个问题也不是太了解，经过翻阅资料得悉。《药师经》全名为《药师琉璃光如来本愿功德经》，而药师咒有称为药师灌顶真言，出自《药师琉璃光如来本愿功德经》。这样一说，我想大家都会有所了解。药师经和药师咒其实就是同一本经书。

一、其实我觉得，两本经文都一样，都是祈愿人们没有病痛，没有灾难，没有业障。都是祝福世人身体健康，万事如意，心想事成的经文。两本经文中都是菩萨对世人的祝愿，都是在用自身的功德为我们祈福。

二、区别在哪里，我们计较那么多干什么，我们一心去研读，去抄写，去体悟菩萨心中所想，心中所念，和菩萨一起为众生求安宁，求太平。我觉的这样就挺好，不管药师经与药师咒有什么区别，我们都去体悟其中的智慧，当我们真正了解其中含义的那一刻，就会知道二者的区别到底是什么。

其实药师咒是包含在药师经的内容 里面的。以上言论是我根据自己查阅得知，如果有哪些地方说的不好，说的不对，还希望各位师兄能够原谅。